パンくずリストの仕様を詳しく教えてください。

表示するパンくずリストは、RMSの商品ページ設定「表示先カテゴリ」で最初に設定しているカテゴリになります。
楽天市場の設定で最初に表示するカテゴリを変更する事で、EC-UPの表示カテゴリを変える事が可能です。